第一期:
為營造新店溪之生態棲地，並改善周邊環境，本局於103年2月20日辦理新店溪魚類生態環境營造第一期工程，工程經費約為新臺幣450萬元，工程內容為於碧潭大橋下游400公尺處施設1道箱型石籠，並配合河道整理300公尺，營造淺潭水域供生態棲息，並於箱型石籠處設置一簡易式魚道，並於魚道上砌排卵石，除使當地生物得以迴游，亦可增加新店溪河川溶氧量，於103年4月28日完工。
第二期:
新店溪魚類生態環境營造第一期工程完工後經檢視成效良好，故本局接續辦理第二期工程，於103年10月20日開工，工程經費約為新臺幣661萬元，工程內容為於碧潭大橋下游600、800、900公尺處施設箱型石籠、簡易式魚道，並自碧潭大橋下游400公尺處（接續第一期工程）辦理河道整理至950公尺處，用以串連各淺潭水域，於104年2月9日完工。